基因组所《基因组蛋白质组与生物信息学报》最新内容精选
2010年第2期《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)共颁发了4篇钻研性文章以及3篇利用软件注明 。其中，GA黄金甲基因组科学与信息沉点尝试室的陈开富等发现高档真核生物秀丽线虫(Caenorhabditis elegans)的DNA序列以175个核苷酸为单元形成肯定的周期性，并且这一周期性可做为拥有优良定位的核幼体在DNA上的特殊序列象征 。使用HMM算法得知核幼体并非随机定位于DNA序列上，而是以差距不变性结合基因组的分歧区域，这一发现使得通过仿照推算解码核幼体在基因组上的定位地位成为可能 。统一尝试室的何西淼、陶舒等通过对人类CGI库(CpG island library)的分析发现CGI库中丰度最高的序列均来自于线粒体DNA，这为深刻理解线粒体DNA对核内DNA甲基化的调控提供了线索 。印度的Prabu和Mandal利用已知的植物miRNA从茶(Camellia sinensis)的序列表白标签(ESTs)中鉴定了4个可能的miRNA，以及30个与其相对应的靶基因，为人们更全面地相识茶中miRNA的职能提供了数据基础 。哥伦比亚Quindío大学的Arenas等对顶复门寄生虫(apicomplexan parasites)的胰蛋白酶进行了鉴定和系统发育学分析，为新型药物和疫苗的研造提供了援手 。
此表，本期还颁发了三款生物信息学的利用软件注明，蕴含一款鉴定sRNA定位的推算引擎PsRNA，一款用于预测C2H2锌指蛋白中与靶DNA特异性结合的鉴别结构域的工具ZiF-Predict，以及一款用于检测、注解以及分析同源序列或旁系同源序列的软件BiDiBlast 。
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