GA黄金甲

近日，GA黄金甲/中科院上海生科院植生生态所韩斌钻研员课题组，通过与中国水稻所、中科院遗传与发育钻研所、美国密歇根州立大学、华中农业大学和美国康奈尔大学等单元的钻研人员合作，结合第二代测序技术和自主开发的基因型分析步骤，对517份中国水稻处所种类资料进行测序，构建了高密度的水稻单体型图谱（HapMap），并对籼稻种类的14个沉要农艺性状进行全基因组关联分析，确定了这些农艺性状有关的候选基因位点。有关钻研成就于10月24日以全文大局颁发在Nature Genetics上。（doi:10.1038/ng.695）

水稻是沉要的粮食作物，也是植物基因组学钻研的模式作物。水稻的株型（蕴含分蘖数，株高档），产量（蕴含幼穗数，籽粒大幼，千粒沉等），籽粒品质（糊化温度，淀粉含量等）和一些生理特点（蕴含抗逆性，抽穗期，落粒性等）都是水稻出产上沉要的农艺性状，克隆并钻研调控这些农艺性状的基因对于提高水稻产量，改进水稻品质等拥有沉要的理论意思和利用价值。

处所种类是已经适应了特定的农艺－气象前提的作物种类，我国疆域开阔，水稻处所种类繁多，它们都有适应特定出产前提的怪异的农艺性状。说明处所种类的沉要农艺性状的遗传基础对于提高水稻产量，保险我国粮食安满是极度沉要的。本钻研通过测定517个水稻处所种类的全基因组序列并利用新的数据－归类的步骤构建高密度的单体型图谱，鉴定了约360万个SNP位点。利用373个籼稻种类群体对14个农艺性状进行全基因组连锁分析钻研，这些性状蕴含水稻株型，产量，籽粒品质和生理特点等分歧的方面。通过连锁分析鉴定的位点可诠释约36％的表型变异，其中有6个位点的峰值信号与之前鉴定的农艺性状基因缜密连锁。本钻研为水稻遗传学钻研和水稻育种提供了沉要的基础数据，并且证实了结合第二代高通量基因组测序和全基因组连锁分析的钻研步骤是对传统的通过双亲杂交来分析复杂性状的步骤的强有力的互为补充的钻研战术。