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GPB 2014年第3-4期内容简介

  2014年第3Genomics, Proteomics & BioinformaticsGPB)纸质版期刊已经出版,共颁发文章7篇  。本刊执行副主编胡松年博士(本所)钻研组,就幼鼠诞生后大脑发育过程中转录组表白进行了钻研,发此刻未成年阶段基因表白最为活跃,为明确哺乳动物诞生后大脑发育的分子机造提供了理论凭据; 

  高友鹤博士(中国医学科学院)等钻研了分歧利尿剂对尿蛋白质组的影响,发现利尿剂显著影响尿液中的一些生物象征物的表白,提醒将来生物象征物的钻研应仔细评估药物的潜在影响; 

  马林博士(解放军医院)等钻研了疾病有关基因calsequestrin 1 (CASQ1) 的多态性和热射  。ǔ炼戎惺睿┝俅仓副甑墓叵,发现SNPA175G与热射病显著有关,进一步的钻研将有利于相识肌肉扰爪激过程中的钙调节分子机造; 

  Sudip Kundu博士(印度)等研发了一种新工具——C2Analyzer,可明确鉴定指标miRNA的结构和GO系统,同时,miRNA间的函数关系能够保留以备将来用做职能网络分析使用,该工具可在www.bioinformatics.org/c2analyzer免费下载使用; 

  宁康博士(中科院青岛生物能源与过程钻研所)等钻研分歧的DNA提取步骤对六味地黄丸的生物学组成成分鉴定的影响,为将来传统中药生物学钻研提供了有效规划;高占成博士(北京大学人民医院)等对人类咽部微生物菌群进行了钻研,以为它们可能在呼吸路习染的预防中起积极的;ぷ饔,这为此类疾病的医治提供了新的思路; 

  本期新增长数据库更新栏目,Peter K. Rogan博士(加拿大)指出之前颁发在本刊2013年第2期的一个mRNA拼接突变分析数据库软件此刻能够提供网上服务,使用地址为http://shannonpipeline.cytognomix.com  。 

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第三期封面

  2014年第4GPB即将出版,蕴含1篇远景瞻望,2篇综述,1篇快迅和1篇步骤文章  。其中,由本刊副主编章张博士(本所)等撰写的远景瞻望,初次确定了Biocuration的中文翻译,指出目前中国在能力域钻研面对的挑战,极度值得思虑和推动,拥有很强的前瞻性; 同时单一介绍了Biocuration国际会议,为将于2015423-26日在北京进行的第八届Biocuration国际会议(Biocuration2015)预热  。本所是Biocuration2015的协办单元,GPB也将以参展单元的身份参会,迎接有兴致的人员关注、参与  。关于会议更多详情请登陆http://biocuration2015.tilsi.org/  。 

  神经系统疾病蕴含中枢神经系统中多种复杂的疾病,由于很难靠近病理中心,因而这类疾病的基础和转化医学钻研都受到了很大的限度  。但随着目前测序技术的飞快发展,使钻研该类疾病的分子机造和生物学象征物成为了可能  。本刊副主编雷红星博士(本所)钻研组,就神经退行性疾病和神经发育阻碍疾病,以钻研最宽泛的阿尔茨海默病和自关症这两类最为严沉的神经系统疾病为例,对最新基因组学钻研进展进行了综述,很有针对性和领导意思  。 

  沉复DNA序列是真核基因组的重要组成部门,可能拥有种属特异性,是分类学和系统产生学钻研的沉要工具  。Shweta Mehrotra博士(印度)等对植物核DNA沉复序列在类型、散布、进化和职能上的最新钻研情况进行了综述,随着基因组学技术的进取,此类钻研将能更好地援手人们相识复杂真核生物的产生、发展过程  。 

  鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii)是医院中一种极度沉要的前提致病菌,其对于多种药物的耐药性近年来也有越来越多的报路,而质粒被以为与耐药性有关  。因而,本刊编委顶峰博士(天津大学)等通过对Acinetobacter baumannii MDR-TJ的全序列进行测序分析,发现了一种新质粒——pABTJ2,并对该质粒进行了具体的分析钻研,以为其蕴含的多种噬菌体样元素和tRNA编码基因与耐药性有亲昵关系,这将援手钻研者们更好地钻研Acinetobacter baumannii的耐药性  。 

  说明复杂生物系统间相互作用的个性是蛋白质间相互作用网络分析和推算生物学分析的重要钻研指标  。Massimo Natale博士(意大利)等开发了一个Cytoscape2.8版本的插件——FunMod,可挖掘无方向性的蛋白相互作用的网络数据、揣度相互作用蛋白的子网络数据、发现与疾病有关的通路,并通过拓扑结构分析来描述各个蛋白及其有关的生物学通路,以援手人们更好地进行有关数据的判读、分析  。 

  另表,GPB将在明年4月出版Biomarkers for Autoimmune Diseases的专刊,由University of Texas Southwestern Medical CenterEdward Wakeland博士和Quan-Zhen Li博士共同担任Guest editors,迎接各人积极投稿,详情请查看Call for paper  。 

  以上两期文章全文均可在GPB主页(http://www.elsevier.com/locate/gpb)或ScienceDirect数据库(www.sciencedirect.com/science/journal/16720229)中浏览下载,迎接各人阅读、引用  。 

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第四期封面

  敬请等待GPB 10月出版Translational Omics专刊

  GPB将鄙人一期(2014年第5期)出版“Translational Omics”的专刊,由本刊副主编方向东博士(本所)和本刊编委Andreas Keller博士(德国Saarland University共同担任Guest editors  。目前已接管的稿件中,蕴含来自Ashok Amin博士(美国Virginia Tech)、祁鸣博士(美国University of Rochester Medical Center/深圳华大基因/浙大医学院第一从属医院/沃森基因)、吕有勇博士(北大)、饶绍奇博士(广东医学院)和严江伟博士(本所)的文章,内容涉及基因组学、蛋白质组学及生物信息学技术在肿瘤等疾病及法医学方面的利用,均为约请来稿  S痈魅斯刈⒈咀  。 

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