GA黄金甲

　　结核病是全球最常见的传染病之一，据WTO“2015年全球结核病年报”汇报，2014年全球新增习染人数960万，殒命150万，新增耐多药结核（MDR）病例48万（其中我国新增结核习染病例93万，居全球第三位），其目前仍是全球第二大传染病。结核分枝杆菌复合群（Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC）是引发结核病的罪魁，其重要蕴含结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）、非洲分枝杆菌（Mycobacterium africanum）、牛分枝杆菌（Mycobacterium bovis）和田鼠分枝杆菌（Mycobacterium microti）。MTBC成员在基因组序列上类似性超过99%，但是分歧的谱系在毒力和宿主上有着较大的差距。DNA甲基化对于基因表白的时空特异性钻研拥有沉要意思，因而成为表观遗传学的钻研热点。然而，自1998年第一篇结核分枝杆菌全基因组在Nature杂志上颁发至今，其全基因组甲基化图谱并未揭晓。 

　　为了全景式解析MTBC的基因组甲基化图谱，中科院北京基因组钻研所基因组科学与信息沉点尝试室陈非钻研组和首都医科大学从属北京胸科医院国度结核病临床尝试室黄海荣钻研组合作，拔取了分属分歧谱系的12株MTBC（蕴含牛分枝杆菌、卡介苗、田鼠分枝杆菌、非洲分枝杆菌、6株临床结核分枝杆菌，以及结核分枝杆菌尺度株H37Rv、H37Ra各1株），利用Pacbio三代单分子实时测序技术（Single-Molecule Real-Time, SMRT）对它们的全基因甲基化组进行了全方位的解析。该钻研共鉴定到了3种MTBC中特有的^m6A甲基化基序及相对应的甲基转移酶基因——mamA、hsdM 和mamB，并通过尝试验证了上述酶的活力。通过比力基因组学的钻研，该钻研还发现了导致甲基化酶失活的基因突变或缺失。 

　　上述钻研团队还通过深刻挖掘Pacbio三代测序所获得的数据，借助于对单元点甲基化比例的推算，得到了MTBC的精准甲基化图谱，揭示了细菌中也存在大量的“部门甲基化”及“未甲基化”位点，注明细菌的基因组DNA甲基化也可能如真核生物细胞DNA甲基化一样拥有复杂的调控机造。经过进一步的深刻探索还发现，大部门未甲基化位点与转录因子结合区域沉合，暗示转录因子的存在可能；ふ庑┣蛎庥诩谆。 

　　该项钻研不只揭示了MTBC的全基因组精准甲基化图谱，并且提出了在MTBC中DNA甲基化建饰可能行使表观调控作用的假说，为钻研结核病病原菌的表观表型特点提供了别样的解析视角。此表，该钻研还批注Pacbio三代测序平台在精准表征核酸表观遗传建饰上拥有巨大潜力，为深刻探索核酸表观遗传建饰的精准调控机造提供了新的工具和思路。 

　　该钻研成就于2015年12月在线颁发于国际驰名期刊Nuclear Acid Research 上。该钻研得到GA黄金甲沉点部署项目、沉大传染病防治沉大专项等赞助。 

 　　12株MTBC基因组信息和DNA甲基化信息图 

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