GA黄金甲

基因组所开发LncRNAWiki数据库参与国际RNA数据库同盟(RNAcentral)

  近期,由基因组所开发的长非编码RNA钻研领域特色数据库LncRNAWiki被国际RNA数据库同盟(RNAcentral)收录。近些年长非编码RNA成为国际钻研的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病产生亲昵有关,在疾病诊疗方面阐发出了潜在的沉大利用价值。长非编码RNA的数量与种类均急剧地增长,大量有关钻研不休丰硕着我们对长非编码RNA职能与作用机造的意识。与此同时,长非编码RNA有关的数据库也在不休增长。2014年,基因组所性命与健全大数据中心章张钻研员携带的科研团队选取Wiki技术开发了基于群体审编(Community Curation)的人类长非编码RNA知识库LncRNAWiki,该知识库作为一个信息丰硕的人类长非编码RNA知识库受到了国际RNA同盟(RNAcentral)的关注,有关钻研人员也将应邀参与由其进行的年度同盟会议。 

  LncRNAWiki整合了来自于GencodeLNCipediaNONCODElncRNAdb的十万多条人类长非编码RNA序列及信息,并凭据基因组地位对长非编码RNA进行分类。利用Wiki系统的优势,成立多人协同注解的结构与模式,凭据参加人员的编纂数量与质量,对参加人员的贡献进行量化打分,且凭据分值大幼赐与作者身份,以此推进长非编码RNA钻研领域科研人员共同美满LncRNAWiki的有关信息和数据更新。有关成就于201411月在国际生物信息学领域期刊《Nucleic Acids Research》在线颁发后,该钻研团队持续沉点网络了有文件报路的人类长非编码RNA,并进行了人为编纂与注解。目前LncRNAWiki共收录719个文件报路的人类长非编码RNA,其中290个与癌症等疾病有关,同时还开发了相应的算法对长非编码RNA编码的幼蛋白或短肽进行预测,共获得九千多个潜在的由长非编码RNA编码的幼蛋白或短肽。 

  LncRNAWiki的后续工作仍将沉点解析已知的人类长非编码RNA,确保有职能报路的人类长非编码RNA的实时网络与注解 ;诔⑹灾ぞ萆羁套暄杏虢馕龀し潜嗦RNA的职能与作用机造,同时对长非编码RNA的序列特点进行深度挖掘及注解。随着该项工作的不休深刻与美满,将对科研人员越发全面的钻研和把握疾病产生发展的机造机理打下坚实基础。 

  GA黄金甲·体育(中国)官方网站 

  数据库链接:http://lncrna.big.ac.cn 

    RNAcentral链接:http://rnacentral.org/

附件下载:
【网站地图】