GA黄金甲

    从单细胞生物到智人约莫4000百万年进化过程中
，基因不休地获得与迷失
，使得基因都拥有特定的基因春秋（Gene Age）
，并在漫长的演化过程中留下与基因春秋有关的印记（Age-Related Signatures; ARS）。因而
，探求基因春秋与ARS可援手我们深刻揭示分子进化机造、基因职能形成以及人类基因的演化汗青。近期
，北京基因组钻研所“院基因组科学与信息沉点尝试室”、“性命与健全大数据中心」芈张钻研员携带的科研团队通过划分基因春秋
，追忆人类基因演化汗青
，整合分析多组学档次上的ARS
，发展ARS与基因春秋的系统钻研获得了一系列工作进展。该项钻研成就近期在Genome Biology and Evolution杂志在线颁发。

　　在性命与健全大数据中心（BIG Data Center；http://bigd.big.ac.cn）高机能推算平台的有力支持下
，钻研团队首先在钻研技术层面
，基于马尔可夫聚类和系统产生分析的步骤
，将人类基因追忆到26个春秋集中中
，该春秋分类战术极大提升了春秋鉴定中的正确性。在此基础上
，钻研团队整合分析了多组学水平上10种分歧的ARS
，蕴含基因长度、GC含量、表白量、甲基化水平、蛋白与蛋白交互网络（PPIN）等
，通过主成分分析步骤系统解析
，发现GC含量和PPIN是与基因春秋最为有关的两种演化印记。同时
，进一步钻研揭示出与多拷贝基因（Duplicates）相比
，PPIN在单拷贝基因（Singletons）中与基因春秋的有关性更为显著。 

　　该钻研成就将为进一步索求人类基因形成的分子机造（尤其是De novo基因）
，挖掘与癌症有关的基因演化汗青
，以及深刻探求疾病产生发展的机造机理钻研等奠定沉要基础。 

　　此工作获得了中科院战术性先导科技专项赞助、国度高技术钻研和发展打算（863打算）等赞助。 

　　论文链接：http://gbe.oxfordjournals.org/content/early/2016/09/07/gbe.evw216 

　　图1 基因春秋有关的ARS主成分分析