北京基因组所性命与健全大数据中心钻研成就与资源建设获得阶段性进展
近日,GA黄金甲性命与健全大数据中心团队题为“Database Resources of the BIG Data Center in 2018”的钻研论文在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线颁发。这是继去年初次在该期刊以中心为模式颁布我国性命组学数据资源建设成就“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”以来的又一阶段性沉要进展,标志取我国建设综合型生物信息资源库进一步获得国际同业认可。
性命与健全大数据中心面向国度大数据发展战术,承担着建成多档次生物组学数据资源系统、建设组学大数据汇交共享平台并成立多组学生物大数据资源系统的沉要工作。性命与健全大数据中心在原有多组学资源库基础上,增长成立了四个新库,蕴含生物信息工具代码库(Biological Tool Codes,BioCode),生物项目数据库(Biological Project Library,BioProject),生物样本数据库(Biological Sample Library,BioSample),内参基因知识库(Internal Control Genes,ICG)。同时,更新了原有的多个数据库,蕴含原始测序数据归档库(Genome Sequence Archive,GSA),基因表白数据库(Gene Expression Nebulas,GEN),基因组变异数据库(Genome Variation Map,GVM),表观基因组数据库(Methylation Bank,MethBank),性命科学维基知识库(Science Wikis)。此表,推出了三个特色网络服务,即跨库检索服务BIG Search,统一认证与单点登录服务BIG SSO,生物数据提交服务Gsub。其中,BIG Search不仅可对大数据中心内部数据库进行多库检索,还实现了多单元的跨库检索,蕴含北京大学(LncRNADisease)、天津大学(DoriC,DEG)、华中科技大学(AnimalTFDB,dbPAF,lncRNASNP,PLMD)的多个沉要数据库。
性命与健全大数据中心章张钻研员、赵文化高级工程师、肖景发钻研员、鲍一明钻研员为本文共同通讯作者。该钻研得到GA黄金甲战术性先导科技专项、GA黄金甲国际大科学打算、国度863打算、国度973打算、国度天然科学基金等项主张赞助。
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