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基因组所与昆明动物所合作实现犬科数据整合与共享系统研发

  近日 ,由北京基因组所与昆明动物所合作开发的犬科动物数据库iDog正式上线。该项钻研成就以“iDogan integrated resource for domestic dogs and wild animals”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线颁发。iDog是第一个致力于家犬(Canis lupus familiaris)和野生犬科动物的综合性数据资源库 ,为全世界从事科钻研的科研人员提供各类数据服务和在线分析工具。 

  家犬是天然界中种内遗传多样性最为丰硕的物种之一 ,也是很多人类遗传病的基础钻研模型。近年来 ,随着基因组学技术发展 ,越来越多犬种的基因组被解析 ,犬基因、SNP、种类、疾病、基因表白等生物数据也被大量颁布 ,但尚未有提供犬类齐全数据服务的数据库 ,该类钻研带来不便。 

  北京基因组钻研所结合昆明动物所合作开发iDog数据库系统 ,整合丰硕的犬科多组学数据 ,提供统一的数据共享服务。同时 ,还整合了序列比对工具用于线上数据分析以及基因组浏览器用于数据可视化解析。iDog的成立不仅有利于全球领域内犬科动物的钻研 ,同时还为大量的爱狗人士提供了一个用户敦睦的界面查找有关宠物狗信息。 

  iDog拥有优良的可拓展性和持续性 ,重要蕴含基于127个家犬样本基因组沉测序数据产生的变异信息数据库、含有32220个基因的犬科动物基因数据库、基于RNA-Seq测序数据的基因表白数据库、犬科动物有关疾病的文件数据库、人-狗疾病同源信息数据库、犬科动物基因组拼接数据库等。iDog将在持续整合更多的组学数据 ,在Dog10K项主张布景下 ,更新高质量的数据集 ,逐步转化成犬科动物基础钻研的信息知识宝库。 

  该项目得到了GA黄金甲战术性先导科技专项、国度天然科学基金、国度沉点研发打算等基金赞助。 

  论文链接 

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   iDog系统的数据资源 

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