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北京基因组所开颁发观关联分析知识库EWAS Atlas

  近日 ,由基因组所开发的表观关联分析知识库EWAS Atlas正式上线。该项钻研成就以“EWAS Atlas: a curated knowledgebase of epigenome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线颁发。

  近年来 ,随着表观组测序技术出格是DNA甲基化测序技术的发展 ,大量钻研起头关注表观组变异与表型 ,行为和疾病的关系。表观关联分析(EWAS)已经成为解析表观建饰与复杂表型关系的沉要伎俩。大量EWAS钻研产生了数以百万计的表型和表观建饰关联 ,然而不足一个专门的数据库来整合这些贵重的资源。

  北京基因组钻研所性命与健全大数据中心开发了针对EWAS的人为审编知识库EWAS Atlas。萦绕EWAS钻研中的沉要成分 ,EWAS Atlas成立了EWAS钻研的整合与审编尺度。分歧于已有的表观数据资源库 ,EWAS Atlas是一个齐全基于人为审编和文件挖掘的知识库。当前版本的EWAS Atlas重要关注DNA甲基化这一沉要的表观建饰 ,EWAS Atlas一共整合了401篇文件中649个钻研报路的329,172个高质量的甲基化与表型关联。这些关联一共涉及到305种表型 ,1,830个队列以及390种表型本体。此表 ,EWAS Atlas还建设了职能壮大的表型富集工具 ,用于钻研表型与表型、表型与表观变异的关系。将来 ,EWAS Atlas将会整合更多分歧类型的表观建饰 ,并将全基因组关联分析与表观组关联分析相结合。

  EWAS Atlas提供了高效的查问方式 ,科研人员能够通过基因、探针号、表型等信息查问有关的EWAS关联信息。此表 ,EWAS Atlas还提供了批量下载、统计等职能援手用户更好的使用数据库。

  作为性命与健全大数据中心表观知识库的沉要组成部门 ,EWAS Atlas致力于表观关联分析知识的审编、整合与尺度化 ,并最终为钻研复杂表型的表观机造提供援手。

  该钻研得到了GA黄金甲战术性先导科技专项、863打算、GA黄金甲“十三五”信息化专项等基金赞助。

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