北京基因组所开颁发观关联分析知识库EWAS Atlas
近日,由基因组所开发的表观关联分析知识库EWAS Atlas正式上线。该项钻研成就以“EWAS Atlas: a curated knowledgebase of epigenome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线颁发。
近年来,随着表观组测序技术出格是DNA甲基化测序技术的发展,大量钻研起头关注表观组变异与表型,行为和疾病的关系。表观关联分析(EWAS)已经成为解析表观建饰与复杂表型关系的沉要伎俩。大量EWAS钻研产生了数以百万计的表型和表观建饰关联,然而不足一个专门的数据库来整合这些贵重的资源。
北京基因组钻研所性命与健全大数据中心开发了针对EWAS的人为审编知识库EWAS Atlas。萦绕EWAS钻研中的沉要成分,EWAS Atlas成立了EWAS钻研的整合与审编尺度。分歧于已有的表观数据资源库,EWAS Atlas是一个齐全基于人为审编和文件挖掘的知识库。当前版本的EWAS Atlas重要关注DNA甲基化这一沉要的表观建饰,EWAS Atlas一共整合了401篇文件中649个钻研报路的329,172个高质量的甲基化与表型关联。这些关联一共涉及到305种表型,1,830个队列以及390种表型本体。此表,EWAS Atlas还建设了职能壮大的表型富集工具,用于钻研表型与表型、表型与表观变异的关系。将来,EWAS Atlas将会整合更多分歧类型的表观建饰,并将全基因组关联分析与表观组关联分析相结合。
EWAS Atlas提供了高效的查问方式,科研人员能够通过基因、探针号、表型等信息查问有关的EWAS关联信息。此表,EWAS Atlas还提供了批量下载、统计等职能援手用户更好的使用数据库。
作为性命与健全大数据中心表观知识库的沉要组成部门,EWAS Atlas致力于表观关联分析知识的审编、整合与尺度化,并最终为钻研复杂表型的表观机造提供援手。
该钻研得到了GA黄金甲战术性先导科技专项、863打算、GA黄金甲“十三五”信息化专项等基金赞助。
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