GA黄金甲

北京基因组所等结合开产生物进化与多组学综合分析软件

  近日 ,由GA黄金甲北京基因组所与GA黄金甲推算生物学沉点尝试室、北京性命科学钻研院等多家单元组成结合攻关团队 ,合作开发的生物进化与多组学综合分析软件eGPS 1.0 正式在线颁布 。该项钻研成就以“EGPS 1.0: Comprehensive software for multi-omic and evolutionary analyses”为题于6月18日在线颁发于National Science Review 。eGPS1.0网络了生物进化与多组学分析领域的重要软件与可视化工具 ,为全世界从事生物进化与多组学分析的科研人员提供免费的分析平台 。 

  随着二代测序成本的不休降低以及三代、四代测序技术的急剧发展 ,越来越多生物物种的全基因组序列被解读出来 ,多组学数据出现发作性增长的态势 。然而 ,数据的高效挖掘和深度解析却是生物学家面对的又一难题 。该钻研开发了进化基因型-表型系统(eGPS)的多职能软件 ,使用户可能进行全面的多组学和进化分析 。 

  eGPS软件蕴含单机软件版本eGPS Desktop和云推算eGPS Cloud ,可能在分歧平台下运行 ,且利于开发 ,易于利用 。通过eGPS Cloud ,将基因组分析、群体数据分析、进化数据分析、网络分析以及图形可视化这五部门的分析有机整合起来 ,实现远程云推算职能 ,方便用户在不足推算资源的情况下急剧获得运算了局 ,并最终以图形、图表等大局直观展示 。通过eGPS Desktop ,用户无需上传数据即可分析基因组学和蛋白质组学数据 。同时eGPS Desktop还占有美满的进化分析流程 。好比能够直接从基因组序列比对成立物种树 。在eGPS Cloud和其他盛开式在线资源的支持下 ,eGPS Desktop提供了一键点击从候选基因到基因树的分析流程 。egps结合了云推算和桌面利用的优势 ,拥有效户敦睦的图形界面和高度的交互能力 。 

  该项钻研得到GA黄金甲战术先导项目“动物复杂性状的进化解析与调控”的支持 。 

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   eGPS Cloud网页界面 ,共蕴含15个软件以及20个可视化工具 

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