GA黄金甲

北京基因组所(国度生物信息中心)成立基于诱导多能干细胞技术的单细胞突变图谱解析战术

  近日 ,GA黄金甲(国度生物信息中心)蔡军钻研组与王前飞钻研组合作在学术期刊Computational and Structural Biotechnology Journal颁发题为A promising iPS-based single-cell cloning strategy revealing signatures of somatic mutations in heterogeneous normal cells的论文 ,该钻研通过设计细胞造就尝试和基因组比力分析步骤 ,揭示了诱导多能干细胞(iPSCs)的单细胞发源和基因组变异的起源组成 ,构建了单细胞突变图谱解析战术。 

  为了正确检测低频的体细胞突变 ,好比正常细胞群体中的体细胞突变 ,当前已经有钻研开发了MDA、MALBAC、 LIANTI等单细胞直接测序技术 ,但由于单个细胞的DNA含量极度少 ,这些步骤存在扩增不均一、等位基因迷失等问题。单细胞体表造就扩增技术可通过体表造就将单个细胞造就成细胞株而后进行测序 ,通过鉴别细胞株中细胞群体的高频率突变来间接观测单个细胞基因组的体细胞突变情况。该技术基因组覆盖度高、扩增谬误少 ,但只合用于个别类型的干细胞;诖 ,结合尝试设计和基因组比力分析步骤 ,钻研人员解析了诱导多能干细胞基因组变异起源的组成 ,证了然诱导多能干细胞的单个别细胞发源 ,以及单个别细胞与所形成的诱导多能干细胞在全基因组变异图谱上超过90%的类似性 ,并进一步提出了基于诱导多能干细胞技术实现细胞克隆扩增的单细胞基因组变异解析的新战术 ,该战术可用于解析体细胞的基因组变异和谱系演化关系。 

  GA黄金甲(国度生物信息中心)蔡军钻研员与王前飞钻研员为本文的共同通讯作者。GA黄金甲(国度生物信息中心)苗雪霞博士和李玥莹博士为共同第一作者。该钻研得到了国度沉点研发打算、国度天然科学基金、GA黄金甲战术性先导科技专项等基金赞助。 

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诱导多能干细胞基因组变异起源组成的解析战术和克隆扩增模型

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