GA黄金甲

　　生物体的核酸与蛋白质分子的序列组分及有关特点（如GC/AG含量、密码子使用偏好、蛋白质物理化学性质等）对于钻研基因职能和物种演化拥有沉要意思，是理解分歧物种、分歧基因家族以及分歧职能基因之间差距的数据基础。 

　　近日，由GA黄金甲（国度生物信息中心）国度基因组科学数据中心开发的分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics正式上线，旨在对序列组分的动态变动提供综合、全面的展示，以多物种的系统性比力分析为基础，为深刻的分子演化钻研提供沉要的参考和启迪。该钻研成就以 “CompoDynamics: a comprehensive database for characterizing sequence composition dynamics”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线颁发。 

　　CompoDynamics针对RefSeq数据库的基因组注解信息，别离推算分析了基因和基因组层面的3类序列组分特点（碱基组成、密码子使用偏好、氨基酸组成）和3类有关序列特点（编码潜能、蛋白物理化学性质、相分离个性）。目前，CompoDynamics共蕴含24,995个物种、34,562个基因组、1,692,647个基因，以及118,689,747条盛开读码框序列。每条序列或每个基因组均有专门页面对各项特点进行详尽展示，并在主页以组分／特点分类展示。用户可通过物种分类、物种名、装配号、基因序列号、蛋白名称等进行检索。此表，CompoDynamics还提供了SpeciesComparator、FamilyComparator、GOComparator和CompoAnalyzer 4个在线比力分析工具，别离用于物种间、基因家族间、基因职能层面的各项组分／特点比力分析，支持对用户提供序列的推算分析，推进多组分特点和多维度的分子演化钻研。 

　　北京基因组所（国度生物信息中心）助理钻研员降帅、硕士钻研生杜强和冯昶瑞为本文共同第一作者，马利娜副钻研员与章张钻研员为共同通讯作者。该钻研得到了科技部、中科院战术性先导科技专项、国度天然科学基金委、中科院青促会项目赞助。 

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