北京基因组所(国度生物信息中心)猴痘病毒基因组信息库MPoxVR获得进展
1970年在刚果民主共和国发现首例猴痘病毒习染者以来,猴痘疫情先后屡次在中西非国度发作。自2022年5月至今,多个非盛行区国度出现猴痘疫情。7月23日,世界卫生组织(WHO)报路已有75个国度和地域汇报16,000余个病例,并将其颁发为国际关注的公共卫生垂危事务(PHEIC)。为支持猴痘病毒有关钻研,援手国内表预防和应对猴痘疫情的发作,GA黄金甲(国度生物信息中心)组建猴痘钻研工作组,于6月10日颁布猴痘病毒资源库MPoxVR。
8月1日,北京基因组所宋述慧钻研员和鲍一明钻研员受邀在国际学术期刊The Innovation 在线颁发题为“MPoxVR – A comprehensive genomic resource for monkeypox virus variants surveillance”的评论文章,系统比力并介绍了猴痘病毒信息库MPoxVR的数据资源及特色职能。
MPoxVR收录整合了迄今为止来自GenBank的777条猴痘病毒和12,065条其它痘病毒科的基因组序列及其对应元信息,并通过人为审编补充了部门序列中缺失的元信息,如宿主、采样日期和采样地址等,为钻研人员发展基于序列的比力、传布演化分析等提供了基础数据资源。
MPoxVR还提供了丰硕的基因组变异和职能注解信息,变异数据提醒,采样自2022年5月疫情发作以来的序列突变较少,大部门序列的SNP变异数量领域为0-11个,沉要职能基因如免疫逃逸、宿主领域、细胞增殖、抗病毒药靶等的突变产生率较低,核酸检测的引物结合区尚未产生新的变异。猴痘病毒的变异信息可为其传布链追踪、溯源、疫情防控和疾病医治等提供沉要的数据信息与决策支持。此表,MPoxVR还开发了四个沉要的在线分析工具,蕴含基因组注解、基因组变异鉴定、变异职能注解和序列类似性比对BLAST。
与国际上其它痘病毒有关数据库相比,MPoxVR是猴痘病毒基因组及序列信息和分析工具的综合专业库,将推进猴痘病毒起源、传布方式等有关钻研,服务于疫情防控。
该工作得到了GA黄金甲青年推进会项主张支持。

MPoxVR数据库序列地理散布和变异数散布
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