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北京基因组所(国度生物信息中心)颁布的人类癌症代谢物关联知识库(MACdb)入选Molecular Cancer Research封面故事

  国际期刊Molecular Cancer Research颁布的第七期杂志,将GA黄金甲(国度生物信息中心)国度基因组科学数据中心开发人类癌症代谢物关联知识库(MACdb)选做封面故事。

  MACdb数据库系统成立了癌症-代谢物关联关系的网络尺度,通过使用一系列本体系统(Ontology)对癌症类型、特点、代谢物尺度化,构建了高一致性的综合知识集中。当前版本的知识库共收录了462篇文件,提取了40,710个癌症-代谢物关联关系对,共涉及到269个癌症特点,涵盖17类高发病率或高殒命率癌症类型,是当前涵盖癌症类型最全的癌症-代谢物关联知识库。MACdb构建了便捷高效的检索和过滤系统,支持从代谢物、癌症类型、癌症特点多层面检索。MACdb也提供一系列分析和可视化职能用于提供超过单篇文件的癌症-代谢物知识网络。同时知识库构建了代谢物的尺度化及癌症类型和特点富集工具,使得用户可能方便的实现对代谢物的尺度化和对癌症类型及特点的富集。

  Molecular Cancer Research杂志评价该数据库拥有加快癌症代谢假说天生和钻研的潜力。MACdb的构建,为钻研人员提供了通过深刻钻研癌症与代谢物之间的关联的知识平台,能够援手钻研人员更好地理解癌症的发朝气造和进展过程,从而为癌症的预防、诊断和医治提供新的思路和步骤。

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MACdb封面

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