GA黄金甲

　　前列腺癌是一种复杂且多见的泌尿系统肿瘤。肿瘤细胞、免疫细胞及有关基质细胞等多种细胞类型共同组成炼杂的 “前列腺癌生态系统”。肿瘤细胞之间以及肿瘤细胞与微环境细胞之间存在大量的相互作用，赋予了肿瘤细胞宽泛的非遗传异质性与可塑性。同时，肿瘤产生过程中由于普遍存在基因组不不变性，逐步堆集了大量的遗传变异。携带该遗传变异的肿瘤亚克隆在不休演化的过程中获得了新的适应性变动，但肿瘤的亚克隆演化与肿瘤细胞转录态可塑性之间的关联并不极度明显。

　　3月24日，GA黄金甲（国度生物信息中心）慈维敏团队与北京大学第三医院贺慧颖团队及北京大学第一医院周利群、李学松团队合作，利用单细胞转录组测序技术，发此刻肿瘤的进化过程中分歧的肿瘤亚克隆获得了各自主导性的转录亚型，这些亚型阐发出分歧的细胞分化状态。此表，亚型及亚克隆内部门别存在相互作用，且二者与肿瘤生态系统中的其他基质细胞或免疫细胞之间存在亲昵联系。这些转录水平上的异质性和肿瘤生态系统的多样性与患者的预后有关。该钻研以“Single-cell RNA-seq reveals a developmental hierarchy super-imposed over subclonal evolution in the cellular ecosystem of prostate cancer”为题，颁发在Advanced Science杂志。

　　该钻研通过单细胞转录组测序技术对14例未经医治的晚期前列腺癌患者的肿瘤异质性进行了描述。通过inferCNV在所有患者中鉴定了肿瘤亚克隆，通过对肿瘤细胞进行无监督聚类鉴定出分歧分化状态的四种转录亚型，EMT样（亚型0），腔上皮A样细胞（亚型1），腔上皮B/C样细胞（亚型2）和基底样细胞（亚型3）。每个患者都含有分歧比例的上述4种肿瘤转录亚型。钻研发现，分歧的肿瘤亚克隆拥有各自主导性的转录亚型。这批注，在肿瘤亚克隆进化过程中逐步产生歧化，产生了适应性的、拥有各自特点的转录态。另表，含有高比例肿瘤转录亚型0的亚克隆在肿瘤细胞内和与其他细胞群之间的通讯强度较弱，这提醒短缺了细胞-细胞间信息交互后，肿瘤细胞获得了间质表型以适应不休变动的微环境。最后，通过整合TCGA大样本队列分析发现，肿瘤细胞转录态和肿瘤生态系统多样性都与肿瘤预后有关。上述了局批注，单细胞转录组测序能够用于深度描述肿瘤细胞异质性，并可能对个性化医治产生沉要影响。

　　中科院北京基因组所（国度生物信息中心）慈维敏钻研员、北京大学第三医院病理科贺慧颖副教授、北京大学第一医院泌尿表科周利群教授、李学松教授为本文共同通讯作者
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　　论文链接

肿瘤微环境异质性增长驱动肿瘤细胞克隆产生转录状态扭转