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国度基因组科学数据中心成立三周年

  2019年6月5日科技部、财政部结合颁布了国度科技资源共享服务平台名单 ,其中依附GA黄金甲(国度生物信息中心)成立国度基因组科学数据中心(National Genomics Data Center ,NGDC)。NGDC运行三年来 ,在主管部门、专家照拂的领导以及依附单元、共建单元与合作同伴的支持下 ,面向我国人丁健全和社会可持续发展的沉大战术需要 ,获得系列沉要进展和成就 ,为国度基因组科学数据的归档共享、安全治理和挖掘利用提供了沉要支持 ,入选国度“十三五”科技创新成就 ,荣获“全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进集体”。?

  建成多组学数据资源系统 ,跻身全球生物数据中心?

  性命健全大数据是关系到国度人丁健全和生物安全的沉要基础资源。针对我国组学数据存、管、用的现实需要 ,NGDC持续升级更新数据资源 ,从2019岁首的15个数据?槔┐蟮侥壳暗9大数据类型63个数据库 ,建成拥有自主知识产权、安全可控、涵盖国度人类遗传资源和沉要战术生物资源的多组学数据汇交、存储和共享系统 ,形成“数据—信息—知识”一体化资源系统。?

  2019年6月至今 ,NGDC在国际权威期刊《核酸钻延追颁发论文19篇 ,被该刊称为与美国国度生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息学钻研所(EBI)并列的全球重要生物数据中心。?

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?  NGDC建成多组学数据资源系统?

  建设组学数据治理系统 ,保险数据安全?

  在性命科学钻研领域 ,钻研者获得的组学数据 ,均需上传到学界及学术期刊认可的专业数据库。由于国内不足性命健全大数据治理公共平台 ,我国粹者大部门的组学数据都递交到国际核酸序列数据库同盟(INSDC)的三大数据库。为此 ,NGDC开发了国内首个组学原始数据汇交、存储、治理与共享平台——组学原始数据归档库(GSA) ,以及人类遗传资源组学原始数据归档库(GSA-Human)和多元数据归档库(OMIX) ,形成了组学原始数据治理系统(GSA Family) ,被Springer Nature、Elsevier、Wiley、Taylor & Francis及Cell等国际驰名出版机构推荐为核酸数据存储和共享系统 ,获得了性命医学领域内主流期刊认可。目前GSA数据库系统已累计支持科技人员在300衷熠刊颁发钻研论文1018篇 ,为解决持久以来我国生物组学数据汇交共享严沉依赖国际数据库阐扬了沉要作用。?

  截至2022年6月5日 ,GSA数据库系统已接管国度沉点研发打算、国度天然科学基金、中科院战术先导专项等赞助的5423个科技项目数据汇交 ,来自563家单元2605个用户 ,汇交数据量从2019年同期的1.37 PB增长到13.99 PB。同时 ,GSA已实现与美国NCBI序列片段归档库(SRA)的元数据整合 ,实现了有关数据资源在NGDC网站的一站式检索与接见 ,极大提升了国内科研人员查问和获取数据的效能。?

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  GSA数据库系统已汇交数据量达14PB?

  创建新冠病毒信息库 ,服务全球新冠防控?

  NGDC于2020年1月22日率先颁布“2019新冠病毒信息库”(RCoV19)并持续更新 ,同时依附NGDC的基因组数据库(GWH)与NCBI初步成立了新冠基因组序列互换共享机造。截至2022年6月5日 ,RCoV19已收录新冠病毒序列1100多万条 ,为全球181个国度和地域178万余名访客提供数据服务 ,累计数据下载超54亿条 ,为中国—世卫组织新冠病毒结合溯源钻研提供基因组及其变异数据分析支持 ,在病毒溯源、监测、变异演化分析等方面阐扬了沉要作用 ,入选2020年度中国生物信息学十猛进展、2021年度中科院科技创新亮点成就。2021年12月NGDC被科技部授予“全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进集体”称号。?

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?  NGDC荣获“全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进集体”称号?

  开产生物信息分析平台 ,服务用户需要?

  凭据性命科学领域用户需要 ,NGDC近期开发了生物信息在线分析平台(BIT) ,由数据可视化、序列比对、基因表白、表观遗传、基因组组成和新冠序列分析六个专题组成 ,部署了生物信息领域使用最多的BLAST在线工具。BIT将持续网络钻研人员的分析需要和建议 ,集成更多专业化数据分析工具 ,不休优化分析流程和运行参数 ,为用户提供持续不变、方便易用的在线数据分析、挖掘服务。?

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?  NGDC颁布生物信息分析平台?

  拓展国内表合作互换 ,推进盛开共享?

  NGDC积极发展与INSDC的合作互换 ,屡次应邀参与INSDC年会并做汇报 ,推动生物大数据国际合作共享 ,提升我国在该领域的影响力。通过跨库搜索引擎BIG Search ,实现了NCBI、EBI和国内10余家合作同伴的数十个有关数据资源在NGDC网站的一站式检索与接见。目前针对数据互换和存储机造在进一步推动与INSDC的合作。?

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?  2022年5月在线参与INSDC年会?

  为推进全球生物多样性与健全大数据盛开共享 ,NGDC在国际生物科学结合会(IUBS)和“一带一路”国际科学组织同盟(ANSO)的支持下 ,结合巴基斯坦、俄罗斯、沙特、泰国4家学术机构提议成立了国际生物多样性与健全大数据同盟(BHBD)。目前BHBD成员单元达到28个 ,来自亚洲、欧洲、南美和非洲的12个国度 ,已合作颁发论文10余篇 ,培训国表科技人员200多人次。NGDC与巴基斯坦NIH/真纳大学共同发展新冠病毒基因组测序及演化分析 ,并与巴西、俄罗斯、印度、南非有关科研机构结合申报获得金砖国度新冠病毒合作钻研项目。?

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?  2019年7月在巴基斯坦进行国际生物多样性与健全大数据钻研会?

  加强团队建设 ,助力人才成长?

  在做好科研工作的同时 ,NGDC还不休加强人才行列建设 ,通过会议互换、技术培训、实际磨炼等多种大局为青年人才成长提供辽阔舞台。近三年来 ,NGDC造就提升钻研员1名、高级工程师3名、海表引进钻研员1名 ,3人入选中科院关键技术人才 ,1人荣获中科院青促会优良会员 ,2人入选中科院青促会会员 ,1人入选北京市科技新星 ,钻研生获国度奖学金9人次、北京市高校优良毕业生2人次。NGDC人才团队建设获得丰硕成就 ,体现了“国度队、国度人”的优良风貌 ,为承担“国度事、国度责”奠定了坚实基础。?

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?  2021年度NGDC人才荣誉榜?

  作为国度生物信息中心(CNCB)的沉要组成 ,NGDC持续贯彻落实国度科技发展战术和沉大工作需要 ,提升数据安全、数据处置、存储和检索等主题技术 ,研产生物信息大数据关键主题算法和软件 ,加强服务能力和国际影响力 ,存好、管好、用好科学数据资源 ,建设支持我国性命科学发展、国际驰名的基因组科学数据中心。?

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