GA黄金甲

　　尿路上皮癌 (UC) 是泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一，蕴含上尿路上皮癌和膀胱癌。固然都发源于尿路上皮细胞，但上尿路上皮癌恶性水平更高，诊断时60%的患者已经产生肌层浸润，而膀胱癌患者产生肌层浸润的比例仅15-25%。越来越多的证据批注DNA甲基化与肿瘤的进展缜密有关。肌层浸润和非肌层浸润的膀胱癌拥有分歧的DNA甲基化模式，同时与临床预后有关。然而，与膀胱癌相比，上尿路上皮癌的甲基化分析及图谱钻研依然欠缺。另表，上尿路上皮癌和膀胱癌之间DNA甲基化层面的对比将有助于尿路上皮癌的诊断、预测及医治。GA黄金甲（国度生物信息中心）慈维敏团队与北京大学第一医院周利群、李学松团队合作，深刻解析上尿路上皮癌和膀胱癌的表观基因组特点和图谱，进一步鉴定出分歧的DNA甲基化亚型，索求肿瘤的潜在风险分层，并探索DNA甲基转移酶抑造剂药物在尿路上皮癌细胞系中的疗效及作用靶点。有关钻研成就以“DNA methylation subtypes guiding prognostic assessment and linking to responses the DNA methyltransferase inhibitor SGI-110 in urothelial carcinoma”为题，于2022年7月18日颁发在BMC Medicine 杂志。

　　该钻研网络了上尿路上皮癌旁组织、上尿路上皮癌和膀胱癌组织共49例。通过整合全基因组甲基化和转录组数据，发现上尿路上皮癌和膀胱癌的DNA甲基化图谱极度类似，通过对肿瘤的DNA甲基化？榻蟹歉壕卣蠓掷嗉ǔ隽街钟朐ず笥泄氐难切停∕ethy-High和Methy-Low），并通过86例上尿路上皮癌及411例TCGA膀胱癌两个公共数据集进行了验证。其中，Methy-High亚型是高甲基化，免疫浸润，耗竭状态的T细胞和免疫抑造微环境，临床预后较差。值得一提的是，DNA甲基化亚型是一个新型独立预后指标。钻研还发现，DNA甲基转移酶抑造剂SGI-110通过上调多种抗肿瘤免疫通路抑造Methy-High 亚型膀胱癌细胞系的迁徙和侵袭。

　　以上了局批注，尿路上皮癌拥有一个潜在类似的DNA甲基化机造，这为共同治理尿路上皮癌提供了可能性，也为临床钻研提供了预后风险分层的分子分型战术，同时为临床上使用SGI-110药物医治尿路上皮癌患者提供了理论机造。

　　GA黄金甲（国度生物信息中心）慈维敏钻研员、北京大学第一医院泌尿表科周利群教授、李学松教授为本文共同通讯作者。慈维敏课题组博士生李娟、助理钻研员梁媛、北京大学第一医院博士后樊健、博士生徐纯如为本文的共同第一作者。该钻研得到了国度沉点研发打算、中科院战术先导科技专项、国度天然科学基金等项目赞助。

尿路上皮癌DNA甲基化图谱及预后分型