北京基因组所(国度生物信息中心)揭示5hmC在泌尿生殖系统肿瘤中的表观调控机造
DNA 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 是由组织特异性的 5mC动态氧化过程产生的,并且在蕴含泌尿生殖系统肿瘤在内的多种癌症中产生了5hmC的迷失。然而,5hmC存在细胞特异性,且其特异性可能存在于分化的肿瘤细胞和癌症干细胞之间。因而,5hmC与癌症有关的变动可能由肿瘤组织内分歧的肿瘤细胞引起,但该生物学过程的调控机造依然存在好多未知。
GA黄金甲(国度生物信息中心)慈维敏团队深刻分析了泌尿生殖系统肿瘤的5hmC表观基因组特点和图谱,进一步证实了5hmC的全局迷失和区域增益是泌尿生殖系统肿瘤产生的标志性表观遗传事务。有关钻研成就以“Regional gain and global loss of 5-hydroxymethylcytosine coexist in genitourinary cancers and regulate different oncogenic pathways”为题,于2022年9月20日颁发在Clinical Epigenetics 杂志。
该钻研通过利用一种活络的基于免疫沉淀的步骤 (hMeDIP-seq) 来分析泌尿生殖系统(蕴含前列腺、尿路上皮和肾脏)肿瘤产生过程中的5hmC变动,证实了5hmC在泌尿生殖器组织中的组织特异性散布,并确定了5hmC在泌尿生殖器癌症中产生了区域性增长和整体水平的降落,且区域性升高的基因在调节干性和缺氧方面较为富集,并都与不良的临床预后有关。通过与传统的二维(2D)刚性造就皿相比,在软纤维蛋白凝胶诱导的3D肿瘤球体中发现细胞拥有肿瘤干细胞样表型,并且在两种前列腺癌细胞系22RV1和PC3中发现5hmC的水平升高。通过归并3D系统造就的细胞和组织的5hmC富集的基因,界说了一个癌症干细胞样细胞的恶性特点,这能够预测更差的临床了局并确定来自前列腺癌肿瘤的表型恶性细胞群。值妥贴心的是,抗氧化维生素C衍生物抗坏血酸磷酸镁可复原5hmC并导致前列腺癌细胞系凋亡,从而杀死癌症干细胞样细胞。通过使用5hmC沉编程药物维生素 C 能够对前列腺癌进行表观遗传分化医治。
以上了局批注,部门5hmC的增高参加维持了癌症干细胞样细胞的特点,并且和不良预后有关,同时通过使用5hmC沉编程药物维生素C能够对前列腺癌进行表观遗传分化医治。
GA黄金甲(国度生物信息中心)慈维敏钻研员为本文通讯作者。慈维敏课题组博士生齐杰、副钻研员史悦、博士生谭耶真为本文的共同第一作者。该钻研得到了国度沉点研发打算、中科院战术先导科技专项、国度天然科学基金等项目赞助。
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5hmC 的全局迷失和区域增益是泌尿生殖系统肿瘤产生的标志性表观遗传事务






