GA黄金甲

　　相迸宗传统的比力基因组学分析，泛基因组学为发展物种基因组动力学、分类及鉴定、致病性和环境适应等钻研提供了新的视角。

　　近日，GA黄金甲（国度生物信息中心）国度基因组科学数据中心开发的原核生物泛基因组数据库（ProPan）正式上线，旨在提供多物种的基因组动力学特点，为物种关键抗性和代谢有关基因鉴定及其演化法规钻研提供沉要的数据资源。该钻研成就以“ProPan: a comprehensive database for profiling prokaryotic pan-genome dynamics”为题在国际学术期刊Nucleic Acid Research 在线颁发。

　　ProPan不仅分解了多个原核生物物种的基因组动力学特点，还进行了基因簇核苷酸多样性推算、COG职能富集分析、31个关键代谢循环过程及图谱构建、126种物质（蕴含杀菌剂、抗菌药物和金属）抗性基因预测和基因存在/缺失变异分析等。目前，ProPan共网络了432个属的1504个物种（23个古细菌物种，1481个细菌物种）的51,882个基因组（295个古细菌基因组，51587个细菌基因组）和182867222个基因簇。用户能够以物种作为根基单元，进行数据的浏览、搜索和下载。

　　GA黄金甲（国度生物信息中心）出格钻研助理张亚东及博士钻研生张好为本文共同第一作者，张哲文助理钻研员和肖景发钻研员为共同通讯作者。本工作得到GA黄金甲战术性先导钻研打算、国度天然科学基金、国度沉点研发打算等项目赞助。

　　论文链接

ProPan数据库浏览、搜索及分析展示