国度生物信息中心合作揭示RNA m5C建饰调把握血干祖细胞扩增机造
RNA建饰作为一种沉要的转录后调控机造,日益受到关注。其中,m5C(5-甲基胞嘧啶)建饰是RNA上最普遍的建饰之一,它通过影响RNA的出核、不变和剪接等过程参加多种生物学职能。造血干祖细胞(HSPC)是维持血液系统正常职能的主题细胞,它们可能分化为各种类型的血细胞,从而支持性命的持续。HSPC在发育过程中会经历急剧的全局转录沉编程,这些变动对于细胞状态和职能的转变至关沉要,然而背后的分子机造尚未齐全明确,RNA m5C建饰是否在HSPC发育过程中阐扬调控职能也亟待钻研。
2月13日,国度生物信息中心工具开发部杨运桂钻研团队和中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学钻研所)王璐团队、GA黄金甲动物钻研所刘峰团队合作,在Cell Reports?在线颁发题为“RNA m5C methylation mediated by Ybx1 ensures hematopoietic stem and progenitor cell expansion”的钻研论文。该工作揭示了Ybx1蛋白介导的mRNA m5C建饰在发育性造血中的关键作用,并为优化HSPC体表扩增战术提供了新的见解和表观转录组学战术。
钻研人员利用斑马鱼模型,通过转录组测序(RNA-seq)和RNA甲基化测序(RNA-BisSeq)等技术,绘造了自动脉-性腺-中肾(AGM)区新生HSPC、尾部造血组织(CHT)区HSPC和成体肾髓(KM)区HSPC分歧发育阶段的RNA m5C建饰动态图谱。了局显示,在斑马鱼的尾部造血组织(CHT)中,m5C建饰水平最高,并且AGM区新生HSPC发育至CHT区HSPC过程中,m5C建饰水平升高的mRNA表白越发不变。进一步的尝试结合分析批注,RNA m5C建饰的鉴别蛋白Ybx1在CHT区的HSPC中高表白,并通过结合m5C建饰的细胞周期有关mRNA调控HSPC增殖。而Ybx1缺失会显著抑造HSPC的增殖,通过过表白Ybx1蛋白则能够复原其扩增能力。最后,钻研人员在幼鼠胎肝Lineage-Sca-1+c-Kit+(LSK)HSPC模型中观测到同样的生物学景象,批注m5C建饰通过Ybx1蛋白介导细胞周期有关mRNA的不变性,从而调控HSPC的扩增职能在分歧物种中是守旧的。
综上,这项钻研不仅揭示了m5C建饰在调控HSPC扩增中的关键作用,还为HSPC的钻研提供了新的视角,为将来的钻研和临床利用奠定了基础。随着对RNA建饰机造的深刻理解,科学家们有望开发出更多基于RNA建饰的医治步骤,为再生医学和疾病医治带来新的但愿。该文章入选Cell Reports?封面论文。
中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学钻研所)王璐钻研员和国度生物信息中心杨莹青年钻研员、GA黄金甲动物钻研所刘峰钻研员、国度生物信息中心杨运桂钻研员为本文的共同通讯作者,中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学钻研所)博士生刘帆、国度生物信息中心出格钻研助理王梦柯和山东大学性命科学学院博士后高素伟为本文的共同第一作者。该钻研得到了国度沉点研发打算、国度天然科学基金、天津市卓越青年科学基金、GA黄金甲青年创新推进会以及中国博士后科学基金等项目赞助。

Ybx1介导RNA m5C建饰确保HSPC扩增模式图
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