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北京基因组所(国度生物信息中心)开发上线基因序列数据库GenBase

  GA黄金甲(国度生物信息中心)国度基因组科学数据中心(NGDC)最新开发的基因序列数据库GenBase正式上线 ,为科研用户提供基因序列数据汇交共享和查问下载服务 。

  基因的序列和注解信息(蕴含DNA、RNA和蛋白序列信息)是支持基因职能钻研的主题基础数据之一 。伴随生物学的迅猛发展 ,在从前几十年中 ,我国性命科学领域科学家产出了海量的基因序列数据 。为保险我国基因序列数据的主权和安全 ,满足我国科研人员在基因序列数据汇交、治理和共享过程中的现实需要 ,对标美国国度生物信息中心NCBI的GenBank数据库 ,NGDC成立了基因序列数据库GenBase 。

  GenBase的主题职能是存储、治理、共享所有物种基因序劣注注解信息及其编码蛋白质序列 ,可为基因序列数据的汇交、存储、颁布和共享提供一系列Web服务 ;贕enBase的提交系统 ,用户可凭据具体的操作提醒 ,按步骤提交蕴含提交者信息、参考文件、核苷酸序劣注数据起源、数据特点等在内的沉要的实体和元数据信息 。GenBase严格把控数据质量 ,保险基因序列数据的正确性、齐全性和可用性 。GenBase系统的建设遵循国际核酸序列共享同盟(International Nucleotide Sequence Database Collaboration ,INSDC)的有关尺度 ,安身中国 ,服务全球 ,可接管来自全球科研人员的数据提交 ,并且通过数据互换机造实现与GenBank的无缝共享 。同时 ,为保险全球基因序列数据的本地化治理 ,GenBase整合了INSDC颁布的基因序列数据 ,提高国内科研人员查问和获取数据的效能 。目前 ,GenBase可支持用户查问或下载GenBank已公开的4.2亿多条核酸及其编码蛋白质序列 。

  GA黄金甲北京基因组所(国度生物信息中心)针对我国基因组数据“存管用”的现实需要 ,除了GenBase表 ,已成立65个服务于生物医学钻研的公共数据库资源 ,涵盖原始数据、基因组和变异、基因表白、非编码RNA、表观基因组、单细胞组学、生物多样性和生物合成、健全和疾病、文件和教育以及工具等10个大类 ,初步形成了我国性命组学数据安全汇交、治理、共享和利用的数据资源系统框架 ,服务于生物和医学领域的基础和转化钻研 。

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