赋能技术提升 解码病原密码——国度生物信息中心结合广东省疾病预防节造中心进杏装病原微生物基因组测序技术及数据分析”钻研培训
为应对病原微生物急剧变异带来的公共卫生挑战,提升我国疾病预防节造领域新一代基因测序技术的利用水平,国度生物信息中心结合广东省疾病预防节造中心(国度基因组科学数据中心—病原微生物分中心)、广东省预防医学会病原分子诊断和分子盛行病专业委员会、中国医药教育协会医学基因组学与生物信息学专委会,于6月25日至27日在广州进行了“病原微生物基因组测序技术及数据分析”专题钻研培训。本次培训吸引了来自科研院所、医院、广东省疾控系统近60名专业人员,共同聚焦病原基因组学技术前沿,提升病原微生物有关的基因组测序技术和数据分析能力。
培训起头,广东省疾病节造中心病原微生物检验所所长李柏生致辞,他暗示,高通量测序技术作为当前最前沿的病原微生物检测伎俩,为病原体急剧精准鉴定和传染病疫情实时监测提供了强有力的技术支持。为提升疾病预防节造领域专业人员的基因组测序和分析能力,加快高通量测序技术在病原体检测与溯源中的宽泛利用,国度生物信息中心携手广东省疾病预防节造中心,共同组织了本次培训,但愿学员都有所收成。
国度生物信息中心陈非钻研员以《高致病微生物及习染性疾病基因组学钻研范式》为题授课。他从肺结核病的钻研动手,萦绕体检大数据表型组学钻延注基因组盛行病学钻延注多维组学宿主习染机造钻研三方面进行了讲授。李翠丹副钻研员介绍了细菌基因组盛行病学分析及在肺炎克雷伯菌(肺克)中的利用,她从细菌基因组分析的流程和经验、高耐药肺克解析利用、高毒力肺克解析利用、高毒高耐肺克解析利用四个方面,针对细菌基因组分析过程中遇到的问题和解决规划进行了介绍。宋述慧钻研员系统介绍了国度生物信息中心数据资源系统、病原综合信息库及急剧解析与预测预警模型。李论助理钻研员对基于系统发育树、单体型网络演化和序列类似性的病原溯源,MEGA实操操练等在病毒溯源过程中常用的步骤和问题进行了介绍。
中山大学施莽教授以《基于全习染组的病原体检测》为题授课,系统介绍了呼吸路全习染组、媒介全习染组、动物全习染组的病原体检测分析步骤,并介绍了基于全习染组的生态学钻研步骤。广东省公共卫生钻研院刘哲副主任技师介绍了宏基因组测序在疾控工作中的利用,从宏基因组测序样品造备、宏基因组测序数据分析和细菌宏基因组样本造备三方面,对病毒、细菌基因组样本造备的道理、步骤和问题进行了讲授。
广东省疾病节造中心张昌副主任技师携带学员进行了病原微生物高通量测序数据分析在本地云平台的实操。实操内容重要蕴含基因组组装、基因特点分析、溯源分析和宏基因组测序病原体鉴定等。国度生物信息中心高级工程师王彦青系统介绍了国度生物信息中心原始数据与基因组数据汇交系统,解答了学员在汇交中遇到的问题,并网络了学员对于有关系统的定见和建议。
本次培训覆盖疾控从业者、临床检验与传染病防治人员、基因检测技术人员等。通过本次理论培训和现场实操,援手专业人怨仄握了基因组测序技术的最新发展趋向,提升了学员数据分析与现实利用能力。

培训现场






